抗原性质分为两类：完全抗原和不完全抗原。
完全抗原简称抗原。是一类既有免疫原性，又有免疫反应性的物质。如大多数蛋白质、细菌、病毒、细菌外毒素等都是完全抗原。
不完全抗原,即半抗原是只具有免疫反应性，而无免疫原性的物质，故又称不完全抗原。半抗原与蛋白质载体结合后，就获得了免疫原性。又可分为复合半抗原和简单半抗原。复合半抗原不具有免疫原性，只具免疫反应性，如绝大多数多糖（如肺炎球菌的荚膜多糖）和所有的类脂等；简单半抗原既不具免疫原性，又不具免疫反应性，但能阻止抗体与相应抗原或复合半抗原结合。如肺炎球菌荚膜多糖的水解产物等。
根据抗原刺激B细胞产生抗体是否而要T细胞协助分类，可分为胸腺依赖性抗原和胸腺非依赖性抗原。TD-Ag是指需要T细胞辅助和巨噬细胞参与才能激活B细胞产生抗体的抗原性物质。TD抗原免疫应答特点：能引起体液免疫应答也能引起细胞免疫应答；产生IgG等多种类别抗体；可诱导产生免疫记忆。TI-Ag是指无需T细胞辅助可直接刺激B细胞产生抗体的抗原，特点：只能引起体液免疫应答；只能产生IgM类抗体；无免疫记忆
根据抗原的来源可将抗原分为：
（1）异种抗原：来源于不同物种的抗原，如微生物、动物蛋白对于人是异种抗原；
（2）同种异型抗原：来源于同一物种的不同个体的抗原，如来自于另一个个体的血型抗原，主要组织相容性抗原等；
（3）自身抗原来自于自身的抗原，如眼晶状体蛋白等；
（4）异嗜性抗原：又称Forssman抗原，存在于不同物种间的共同抗原，可存在于动物、植物、微生物及人类中，如溶血性链球菌于人心内膜或肾小球基底膜所具有的共同抗原就是异嗜性抗原。